Kekapitanan Jeneral Filipina (Bahasa Sepanyol: Capitanía General de las Filipinas [kapitani.a xeneɾal ðe las filipinas]; Bahasa Filipino: Kapitaniyang Heneral ng Pilipinas) ialah sebuah daerah pentadbiran Empayar Sepanyol di Asia Tenggara yang diperintah oleh seorang Gabenor Jeneral. "Kekapitanan" ini merangkumi Hindia Timur Sepanyol termasuk antara lainnya Kepulauan Filipina dan Kepulauan Caroline. Ia ditubuhkan pada tahun 1565 dengan penempatan Sepanyol yang pertama.[1]Selama berabad-abad semua aspek politik dan ekonomi Kapten ditadbir di Bandar Raya Mexico oleh Viceroyalty di Sepanyol Baru, sementara isu pentadbiran perlu dirujuk dengan Mahkota Sepanyol atau Majlis Hindia melalui Pemerhati Diraja Manila. Walau bagaimanapun, pada tahun 1821, selepas kemerdekaan Mexico, semua kawalan telah dipindahkan ke Madrid. Ia telah digantikan oleh Semenanjung Filipina Pertama yang singkat berikutan Kemerdekaannya melalui Revolusi Filipina.